首先，感染和血脓对于所有的手术来首都是不可控因素，也是几乎所有外科手术都可能存在的并发症。感染和血脓一般发生在术后的一周以内，伴随着会出现红肿热痛，感染严重者会出现局部皮肤潮红青紫或针孔不愈合流脓等症状。

其次，可能会出现脂肪移动的现象，在手术后到脂肪成活前这段时间，移植的脂肪组织存在移位的可能。这多发生在皮下瘢痕组织过多部位，或韧带分布区，如鼻唇沟部位。

第三，局部皮肤凹凸不平：一般会出现在术后3——6个月内。这是脂肪的吸收率所造成，也是目前阶段自体脂肪移植目前比较大的障碍之一。

后，脂肪液化、局部形成硬结：这种情况会在少量的面部填充的手术中发生，出现的原因是单次注入脂肪组织过多，或注入后脂肪组织自然聚集成块，大大降低脂肪存活率，而不成活脂肪的坏死、液化或局部形成硬结。

自体脂肪填充以后，实际上它的危害其实谈不上危害，主要是对于外形方面的一些影响，比如填充的不足，那么填充的局部的过度形成一些硬结等等，那么这些存在的问题都是可以通过一些技术环节，能够把它发生的几率降低到非常低的状态，它主要、比较大的一个危害就是可能会潜在有脂肪栓塞的危险，关于这一问题不用闻栓塞而色变，因为这种经历在临床上是非常少见的，一般找正规的医院，经验丰富的医生，会通过一些少量、多点、多层次的注射，可以避免这种情况的出现。